Τα κακουργήματα για τα οποία κατηγορούνται είναι μεταξύ άλλων αυτά της εγκληματικής οργάνωσης, της απόπειρας ανθρωποκτονίας, της κατοχής εκρηκτικών υλών, της έκρηξης και του εμπρησμού. Όπως έγινε γνωστό, η δίωξη είναι κατά παντός υπευθύνου (in rem) και θα προσωποποιηθεί από το ανακριτή στον οποίο θα κληθούν οι κατηγορούμενοι να απολογηθούν.
Και οι είκοσι κατηγορούμενοι είναι κάτοικοι της Ιερισσού και της Μεγάλης Παναγιάς στα υπομνήματα που παρέδωσαν οι συνήγοροί τους στην Ασφάλεια Θεσσαλονίκης (οι ίδιοι δεν εμφανίστηκαν), αρνήθηκαν οποιαδήποτε σχέση με την επίθεση, ενώ κατήγγειλαν περιστατικά «αστυνομικής αυθαιρεσίας» στη Χαλκιδική μετά την επίθεση στις Σκουριές.
Ωστόσο σύμφωνα με την ΕΛ.ΑΣ το γενετικό υλικό ενός εξ αυτών ταυτοποιήθηκε με ίχνη DNA σε μάλλινο σκούφο που βρέθηκε στο σημείο της επίθεσης. Επιπλέον, για έναν ακόμη προκύπτει από τη βαλλιστική εξέταση σε καραμπίνα που κατείχε ότι χρησιμοποιήθηκε κατά την επίθεση στο εργοτάξιο.