Την αντίρρηση τους στην σύσταση της ΑΑΔΕ (Ανεξάρτητη Αρχή Δημοσίων Εσόδων) εξέφρασαν δια της... δικαστικής οδού, 3 συνδικαλιστικές ενώσεις, ζητώντας να κηρυχθεί παράνομος και αντισυνταγματικός ο νόμος για την εγκαθίδρυση της.Η ΑΑΔΕ ανέλαβε από τις αρχές του έτους τον τομέα της είσπραξης των δημοσίων εσόδων αλλά και της οργάνωσης των φορολογικών ελέγχων. Με την προσφυγή τους στο Συμβούλιο της Επικρατείας, η Πανελλήνια Ομοσπονδία Εργαζομένων στις Δημόσιες Οικονομικές Υπηρεσίες, η Ομοσπονδία Τελωνειακών Υπαλλήλων Ελλάδος, η Ομοσπονδία Συλλόγων Υπουργείου Οικονομικών και 6 πρώην υπάλληλοι του υπουργείου Οικονομικών και νυν υπάλληλοι της ΑΑΔΕ, υποστηρίζουν ότι η σύσταση της ανεξάρτητης αρχής αντιβαίνει το Σύνταγμα, καθώς αναλαμβάνει υποχρεώσεις του στενού πυρήνα του κράτους και δεν υπόκειται σε πολιτικό έλεγχο, παρά το γεγονός ότι υποκαθιστά την κυβέρνηση.
Όπως λένε οι προσφεύγοντες, η ανάθεση στην Αρχή αρμοδιοτήτων που εμπίπτουν στον στενό κρατικό πυρήνα της κρατικής εξουσίας, πλέον του ότι είναι αντισυνταγματική και αντίθετη στην νομολογία του ΣτΕ, σηματοδοτεί το «ακαταδίωκτο» από τα αρμόδια υπουργεία, δηλαδή, δεν μπορεί να ελεγχθεί από αυτά, αφού δεν λογοδοτεί και δεν έχει ευθύνες.
Οι εκπρόσωποι των ενώσεων υποστηρίζουν ακόμη ότι η σύσταση της αρχής είναι παράνομη, γιατί έγινε με απόφαση του διοικητή της και όχι με Προεδρικό Διάταγμα, ενώ επισημαίνουν ότι οι υπάλληλοι που μεταφέρθηκαν από το υπουργείο Οικονομικών και τα Τελωνεία στην ανεξάρτητη αρχή υπέστησαν δυσμενή υπηρεσιακή μεταβολή.